In diesem Spiel könnt ihr euch 51 Trophäen verdienen. Erfüllt die folgenden Aufgaben und sichert euch die entsprechenden Trophäen:
 - Datei R-00: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-00: Wachdienst ab.
 
 - Datei R-01: Status - Geschlossen
 Schließen Sie Datei R-01: Staatsstreich ab.
 
 - Datei R-02: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-02: Forschungseinrichtung ab.
 
 - Datei R-03: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-03: Eine Meile hoch ab.
 
 - Datei R-04: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-04: Feindliche Übernahme ab.
 
 - Datei R-05: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-05: Flucht aus Denver ab.
 
 - Datei R-06: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-06: Badland-Showdown ab.
 
 - Datei R-07: Status - Geschlossen 
 Schließen Sie Datei R-07: Attentatsversuch ab.
 
 - Stahlschweif 
 Schneiden Sie in Datei R-00 Metal Gear RAYs Metallschweif ab.
 
 - Keine Blitzfotos! 
 Zerstören Sie alle Gewehrkameras in Datei R-01.
 
 - Dwarf-Raiden 
 Setzen sie alle Soldaten in Datei R-02 mit einem Dwarf Gekko außer Gefecht.
 
 - Spaziergang im Dunkeln 
 Schließen Sie die Bahnliniensequenz in Datei R-03 ohne Verwendung des ER-Modus ab.
 
 - Gefahr für die Gesellschaft 
 Schneiden Sie die Kreuzblume an der Pagode in Datei R-04 ab.
 
 - Die große Flucht 
 Schließen Sie Datei R-05 in weniger als 7 Minuten ab.
 
 - Überraschungsangriff! 
 Erreichen Sie das Ziel in Datei R-07, ohne entdeckt zu werden.
 
 - Cyborg-Gegner 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 100 Cyborgs.
 
 - Heftige Gegner 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 100 Spezial-Cyborgs.
 
 - Entmilitarisierte Zone 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 100 schwer bewaffnete Cyborgs.
 
 - Herpetophobie 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 10 Gekkos.
 
 - Silberrücken 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 10 Mastiffs.
 
 - Massenaussterben 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 10 Raptors.
 
 - Teichreinigung 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 5 Vodomjerkas.
 
 - Wolfsjäger 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 10 Fenrirs.
 
 - Slider-Jäger 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 10 Sliders.
 
 - Hai-Jäger 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 10 Hammerheads.
 
 - Die süßen Kleinen 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus insgesamt 30 Dwarf Gekkos.
 
 - Runter mit der Maske 
 Zerstören Sie im Geschichtenmodus alle humanoiden Dwarf Gekkos.
 
 - Zandatsu-san 
 Führen Sie im Geschichtenmodus erfolgreich 50 Zandatsus aus.
 
 - Was dich nicht umbringt ... 
 Wehren Sie im Geschichtenmodus erfolgreich 10 Angriffe hintereinander in weniger als einer Minute ab.
 
 - Heimlicher Killer 
 Führen Sie im Geschichtenmodus erfolgreich 30 Ninjakills aus.
 
 - Kein Entkommen vor dem Zufall 
 Führen Sie im Geschichtenmodus erfolgreich 50 Exekutionen aus.
 
 - Friedensbringer 
 Schließen Sie im Geschichtenmodus erfolgreich 10 Kämpfe ohne Kills ab.
 
 - Angriff mit tödlicher Waffe 
 Zerstückeln Sie im Klingenmodus drei Feinde mit einem einzigen Angriff.
 
 - Metzgermeister 
 Zerschneiden Sie im Geschichtenmodus insgesamt 100 Feinde.
 
 - Liebe auf den ersten Blick 
 Kommunizieren Sie im Geschichtenmodus mit allen Dwarf Gekkos, während Sie einen fernsteuern.
 
 - Ich liebe Kapitalismus! 
 Erhalten Sie alle Anpassungsgegenstände.
 
 - Linke Hände 
 Erhalten Sie alle linken Hände der feindlichen Offiziere.
 
 - Kuckuck 
 Entdecken Sie alle in den Pappkartons versteckten Soldaten.
 
 - Data-Mining 
 Erhalten Sie alle Datenspeicherungsgeräte.
 
 - Humanitäre Hilfe 
 Retten Sie alle Zivilisten.
 
 - Analyse abgeschlossen 
 Schalten Sie alle VR-Missionen frei.
 
 - VR-Meister 
 Schließen Sie alle VR-Missionen ab.
 
 - Der Gott der Blitze 
 Schließen Sie den Geschichtenmodus auf dem Schwierigkeitsgrad Revengeance nur mit S-Bewertungen ab.
 
 - Amateurfunker 
 Hören Sie sich den Großteil aller Codec-Gespräche an.
 
 - Praktisch ein Gott 
 Holen Sie einen Highscore bei allen VR-Missionen.
 
 - Revengeance 
 Erhalten Sie alle Trophäen.
 
- Geheime Trophäen 
 - Perfekter Killer 
 Besiegen Sie Mistral auf "Schwierig" oder höher, ohne Schaden zu nehmen.
 
 - Genialer Zerstörer 
 Besiegen Sie Monsoon auf "Schwierig" oder höher, ohne Schaden zu nehmen.
 
 - Wahrhaft menschlich 
 Besiegen Sie Sundowner auf "Schwierig" oder höher, ohne Schaden zu nehmen.
 
 - Von der Geschichte auserwählt 
 Besiegen Sie Samuel auf "Schwierig" oder höher, ohne Schaden zu nehmen.
 
 - Feinde zum Schweigen bringen 
 Besiegen Sie Senator Armstrong auf "Schwierig" oder höher, ohne Schaden zu nehmen.